La Academia tendrá Comisiones Permanentes cuyas funciones serán las de asesorar a la Junta Directiva y colaborar con ella en el estudio de diversos aspectos relacionados con las actividades de la Academia, con el fin de contribuir al logro de los objetivos de la Institución. Igualmente tendrá en su seno y para periodos de dos años a un Director de la Biblioteca, un Curador del Museo y un Historiador de la Academia, quienes serán nombrados por la Junta Directiva, y podrán ser reelegidos.

El Coordinador General de las comisiones es el Vicepresidente:

Acad. Dr. Germán Peña Quiñones