La Academia Nacional de Medicina acoge en su sede al Instituto Colombiano de Estudios Bioèticos, ICEB, a la Sociedad Colombiana de Historia de la Medicina y a la Asociaciòn Latinoamericana de Academias Nacionales de Medicina, España y Portugal, todas ellas instituciones que complementan los objetivos de esta Corporaciòn. En el mismo sentido, acoge a las asociaciones y sociedades científicas que tengan objetivos comunes.